Le « de Netflix » L'agent de nuit ' suit Peter Sutherland en territoire inexploré alors qu'il assume le rôle d'agent de Action nocturne , l'agence dont l'existence lui a été révélée lors de la saison précédente. La dernière fois, il a eu la simple tâche de décrocher un téléphone qui n’était jamais censé sonner. Cependant, sa vie entière bascule, pour le meilleur ou pour le pire, lorsque le téléphone sonne. Au début de la deuxième saison, Peter se retrouve plongé dans une mission censée dénicher une taupe au sein du FBI. Son travail consiste à découvrir à qui la taupe a fourni des informations. Ce qui est censé être une mission simple, Peter et son partenaire sont censés ne rien faire d'autre que d'observer les choses tournent mal, et une fois de plus, Peter se retrouve à remettre en question toutes les personnes en qui il a jamais fait confiance.
Rose Larkin entre en scène lorsqu'elle reçoit un appel d'un inconnu lui posant des questions sur Peter. Ils sont déconnectés depuis des mois et elle s'inquiète pour lui. Pour le retrouver, elle utilise Négatif , une application pour laquelle elle a travaillé mais dont le véritable potentiel n'est encore révélé à personne. Une fois qu'elle a trouvé Peter, elle se retrouve impliquée dans son enquête, ce qui le mène à Digitale pourprée . La seule personne en qui Peter et Rose peuvent avoir confiance (et non sans inhibitions initiales) est Catherine Weaver, qui pense que Peter n'est pas prêt à devenir un agent de nuit. Elle a du mal à lui faire confiance, surtout après que s'est-il passé avec son père , mais en fin de compte, elle doit accepter qu'il est la meilleure option dont elle dispose, surtout compte tenu des circonstances désastreuses.
À la fin de la saison, il est révélé qu'une attaque terroriste est en préparation. Viktor Bala, un dictateur qui purge une peine après avoir été accusé d'avoir tué son propre peuple avec une arme biologique mortelle, a mis ses meilleurs hommes au travail pour semer le chaos à New York, en particulier à l'ONU, en libérant du KX, un puissant agent chimique qui conduit à une mort horrible pour ses victimes. La tâche consiste à arrêter l’attaque terroriste à tout prix, et bien sûr, Peter en paie le prix fort. SPOILERS À VENIR
La première chose que Peter et Catherine doivent comprendre est l'endroit où le KX est fabriqué. Ils savent que Markus, le cousin et homme principal de Viktor Bala, a installé son camp quelque part et a enlevé le professeur Wilfred, qui a travaillé sur Foxglove, pour créer l'agent chimique. Rose est également gardée avec le professeur et la seule raison pour laquelle elle n'a pas été tuée jusqu'à présent est parce que Markus et ses hommes pensent qu'elle est l'assistante de Wilfred. Rose et le professeur fabriquent quelques lots de produits chimiques, ce qui suffit à faire des ravages à New York, mais finalement, ils arrivent à un point où ils doivent accepter qu'ils vont mourir, alors autant planifier une évasion. .
Pendant que Markus est absent, le duo libère intelligemment le produit chimique à l'extérieur de leur laboratoire, tuant plusieurs gardes armés. Une fois l’occasion se présente, ils s’échappent du laboratoire avec la femme et la fille de Wilfred. À peu près au même moment, Pierre arrive également et tout le monde est sauvé. Pourtant, Markus et ses hommes disposent encore de suffisamment de KX pour faire le travail. Le problème est que personne ne sait où ils envisagent d’attaquer. Rose révèle qu'elle les a vus passer clandestinement des uniformes appartenant à l'ONU, ce qui signifie que le bâtiment est leur cible principale. Cela est logique car Viktor Bala leur en veut de l’avoir transformé en méchant alors que les États-Unis sont effacés des mains de Foxglove et de leur implication dans la fabrication et la vente de KX.
Une équipe d'officiers est envoyée dans le bâtiment de l'ONU, où ils retrouvent autant de cartouches de KX que possible. Dans le même temps, Rose les aide à identifier Markus et ses hommes, qui sont presque tous arrêtés ou tués. En fin de compte, toutes les cartouches sauf une sont prises en compte, et Markus est toujours dans le vent, et il peut encore faire beaucoup de dégâts avec le KX dont il dispose. Considérant qu'il ne peut aller que dans quelques endroits, il est décidé de diviser l'équipe et de le retrouver le plus rapidement possible. Peter et Rose s'en prennent à Sloane, la petite amie de Tomas Bala, et bien sûr, Markus s'avère être là.
Le plan de Markus était de s'envoler pendant que la dernière cartouche de KX faisait son travail. L'arrivée de Peter et Rose met un énorme obstacle sur son chemin, et il est abattu par Peter après avoir tenté d'utiliser Sloane comme bouclier. Reste la question du KX. Rose remarque un réparateur qui lui révèle que des problèmes ont été signalés au niveau des bouches d'aération. Pour dissiper ses soupçons, elle suit le réparateur, et il s'avère que Markus avait mis un bidon dans les bouches d'aération, qui se déclencherait dès qu'une certaine marque serait atteinte. La seule façon de fermer les bouches d'aération est de commencer à tirer dans l'une d'elles, et avec seulement quelques secondes restantes, Rose et Peter allument un feu qui déclenche une alarme qui ferme toutes les bouches d'aération avant que le KX ne puisse se propager et tuer chaque personne dans l'hôtel.
Tout a un prix, surtout l'information, et Peter découvre le véritable sens d'un tel accord lorsqu'il se trouve dans une position qui compromettrait son éthique. Alors que le plan de Viktor Bala concernant KX devient clair, Peter se rend compte que Rose court un bien plus grand danger et qu'il doit la sauver avant tout le monde. Elle est la seule personne qui lui tient à cœur, c'est pourquoi il est prêt à faire tout ce qu'il faut pour la sauver. Le seul problème est que la sauver signifie se condamner. Jacob Monroe est prêt à lui dire où Markus gardait Rose, mais en échange, Peter doit lui voler un dossier de l'ONU. Une fois que cela sera fait, Monroe supprimera toutes les preuves de la présence de Peter dans le bâtiment de l'ONU, mais il gardera ces preuves pour lui et les gardera au-dessus de la tête de Peter pour le reste de sa vie.
Même s'il sait que toute sa réputation et sa carrière seraient ruinées s'il volait le dossier, Peter le fait quand même pour sauver Rose. Ce n’est que bien plus tard qu’il découvre ce que contient le fichier et pourquoi Monroe le voulait tant. Il s’avère que l’un des candidats à la présidence des États-Unis était autrefois le chef de la CIA, et c’est lui qui a dirigé Foxglove et a donné KX à Viktor Bala pour qu’il commette le massacre de son propre peuple. Lorsque Bala a été arrêté pour crimes de guerre, l’ONU a caché les preuves de l’implication du chef de la CIA, et pendant une minute, il a semblé que tout cela avait été enterré pour de bon. Son entretien au cours de l’enquête sur l’affaire a été conservé dans les archives de l’ONU, et c’est ce que Peter a obtenu pour Monroe.
Monroe a remis le dossier à Hagan, l'autre candidat principal à la présidence. Avec une telle preuve condamnante contre la moralité de son concurrent, Hagan n’a pas pu s’empêcher de la divulguer aux médias. Une fois la vérité sur son implication révélée, l'ancien chef de la CIA et candidat à la présidence a dû retirer sa nomination, laissant Hagan comme seul choix pour être le prochain président des États-Unis. À la fin de la saison 2, Hagan n’a pas encore pris ses fonctions, mais c’est inévitable. Cela signifie également que Jacob Monroe sera dans une position beaucoup plus puissante, ce qui ouvre la porte à Peter pour se racheter.
Dans le feu de l’action, Peter a dû faire des choix très difficiles. Il n’avait pas beaucoup de temps pour réfléchir, ce qui signifiait qu’il devait choisir ses priorités, et à l’époque, rien ne semblait plus important que de sauver Rose. Elle avait été enlevée par Markus et forcée de faire du KX avec le professeur Wilfred, dont la famille était en danger. Alors que le temps passait pour l’attaque terroriste dont Peter savait qu’elle allait arriver, il n’avait pas beaucoup de temps pour retrouver Rose et la mettre hors de danger. Alors, il a passé un pacte avec le diable. En apparence, cela aurait ressemblé à un accord ponctuel, mais Peter savait qu'une fois qu'il aurait rendu service à Jacob Monroe, il appartiendrait à l'agent de renseignement.
Lorsque l'attaque terroriste est déjouée et que Rose est saine et sauve, Peter décide de se rendre. Il sait mieux que de continuer à travailler dans Night Action et à donner plus d'informations à Monroe pour sauver sa peau. Ce serait un cycle terrible dont il ne pourrait jamais se libérer, alors il choisit de dire la vérité, même s'il sait que cela pourrait signifier finir en prison. Et c’est ce qui arrive pendant un moment. Compte tenu du passé de sa famille, son père s’étant également révélé être une taupe dont les actions ont conduit à une brèche dans le Pentagone, les supérieurs de Peter ne sont pas très enclins à le laisser partir aussi facilement. Il passe des semaines en cellule, puis la bombe tombe.
Il s’avère que l’enregistrement qu’il a donné à Monroe a été utilisé pour exclure la compétition de Hagan de la course, ouvrant ainsi la voie à la Maison Blanche. C’est pire que la brèche du Pentagone, car cela signifie que le président lui-même est compromis, ce qui signifie qu’aucun secret d’État n’est en sécurité. Les temps désespérés appellent des mesures désespérées, et Catherine sait que la seule façon de sauver la situation est d'utiliser Peter. Si Monroe avait son homme au sein du gouvernement, alors il devrait y avoir un homme du gouvernement dans ses rangs, qui l'espionne et équilibre la balance. Parce que Peter est déjà sous l’emprise de Monroe, cela n’a aucun sens de l’envoyer en prison.
Ainsi, Peter est licencié à condition de servir d’agent double. Monroe pense avoir un homme à l'intérieur de Night Action, la seule agence qui était hors de sa portée depuis si longtemps. Cependant, seules Catherine et quelques autres personnes savent que Peter va en réalité infiltrer l'ensemble de ses opérations et éliminer tous ceux qui travaillent secrètement pour lui. C’est la seule manière de s’assurer que tous les méchants soient exclus du système gouvernemental, du moins ceux qui travaillent pour Monroe, et que le pays puisse éviter d’être vendu au plus offrant.