Chez Takashi Yamazaki Godzilla moins un », le public est transporté dans le Japon de l’après Seconde Guerre mondiale, encore sous le choc des bombes atomiques, menacé par un nouveau monstre capable de raser les villes d’un seul coup. Le protagoniste de l'histoire est un jeune pilote kamikaze nommé Kōichi Shikishima, qui a survécu de justesse à la guerre, pour ensuite se retrouver au milieu des ravages causés par Godzilla. La créature devenant de plus en plus puissante à chaque coup, il devient clair pour les habitants de Tokyo qu'il faut l'arrêter une fois pour toutes pour qu'ils puissent reprendre leur vie en main et reconstruire le pays. Mais la tâche est plus facile à dire qu’à faire, car l’ADN de Godzilla le rend insensible à la mort.

Godzilla est un être énorme capable d'écraser des bâtiments entiers sous ses pieds, mais sa taille en fait également une cible plus facile et beaucoup plus facile à tuer. Et compte tenu de tout ce qui lui a été lancé, des balles aux bombes nucléaires en passant par toutes sortes d'autres monstres, Godzilla serait mort à coup sûr sans un pouvoir spécial dans son ADN qui le rend apparemment invincible.
Godzilla, tout comme Wolverine de l'univers Marvel, possède un pouvoir exceptionnel pour se soigner. Peu importe ce qui lui sera lancé, les cellules de la créature se régénéreront, ses blessures guériront et il sera de nouveau sur pied. En fonction de l'arme et de la gravité des blessures qui lui sont infligées, le moment de la régénération peut différer, mais quoi qu'il en soit, Godzilla guérira toujours et redeviendra comme neuf, prêt à déchirer ses ennemis ou à les écraser sous ses pieds.
C’est cette qualité particulière qui rend les cellules de Godzilla si spéciales. Appelés cellules G, leur pouvoir régénérateur est suffisamment tentant pour que les scientifiques mettent la main dessus, mais il y a autre chose qui les rend encore plus puissantes. Godzilla étant radioactif, ses cellules ont un pouvoir mutant. Cela signifie qu’ils peuvent conduire à la création d’êtres mutés plus proches de lui en taille et en puissance, et c’est ce que les scientifiques exploitent dans plusieurs versions de l’histoire. Dans 'Godzilla Minus One', un accent particulier est mis sur sa capacité de régénération alors que les propriétés spéciales des cellules G ouvrent la voie à de futures possibilités, dont l'une est évoquée dans la scène finale lorsque Shikishima découvre que Noriko est vivante et se remet de ses blessures infligées par la dévastation de Godzilla à Tokyo.

Pour avoir croisé la route de Godzilla à plusieurs reprises, Shikishima sait qu'il n'est pas facile de tuer la créature. Aucune arme mortelle ne semble avoir la capacité de le faire, et ils ont essayé tout ce qu'ils pouvaient. Mais Godzilla a détruit des navires de guerre et décimé des villes d’un seul coup. Comment de simples armes et bombes peuvent-elles avoir un impact sur lui ? Shikishima le sait très bien, et il sait aussi que pour tuer Godzilla, il aurait besoin du pouvoir de Godzilla.
Dans le combat final, Godzilla est attiré dans la mer, où le plan est de le piéger avec des cylindres pleins de fréon qui l'emmèneraient au fond de l'océan, où la pression de l'océan le tuerait. Si cela ne se produisait pas, ils lâcheraient alors une bouée qui ramènerait la créature à la surface avec une telle vitesse qu’elle serait écrasée par la pression. Le plan fonctionne presque jusqu'à ce que Godzilla se libère de la bouée et du Fréon et soit prêt à lancer sa canicule sur les navires pour les détruire.
Shikishima savait que le plan échouerait, mais il savait aussi que cela mettrait Godzilla en colère suffisamment pour lui faire profiter de la canicule. Désormais, l’homme sait aussi qu’il faut quelques secondes au créateur pour activer l’énergie et la libérer. Ayant anticipé les événements, Shikishima se prépara à faire quelque chose que lui seul pouvait faire. Il a été formé comme pilote kamikaze et, même s'il a échappé à son devoir de guerre, il savait qu'il devait le faire cette fois-ci ou faire tuer tout le monde par Godzilla. Après la mort de Noriko à Ginza, il est motivé pour la venger ainsi que les soldats qui ont été tués par la créature sur l'île d'Odo.

Comme prévu, juste au moment où le plan échoue et que Godzilla remonte à la surface, il active le souffle de chaleur. Shikishima, qui planait à proximité, vole vers sa bouche. Son avion était équipé de suffisamment d'explosifs pour raser une ville, mais Shikishima savait que même dans ce cas, cela ne suffirait pas. Il lui faudrait synchroniser leur explosion avec la vague de chaleur de Godzilla juste avant sa sortie. Et ainsi, dès qu’il voit la queue de la bête devenir bleue sous l’effet de l’énergie, il se dirige vers lui et atteint juste à temps pour lui écraser le plan dans la bouche. Lorsque l'avion explose, le chemin de la vague de chaleur est bloqué et au lieu de sortir, elle explose dans sa bouche. Même si les explosifs artificiels n’auraient pas eu d’impact sur Godzilla, sa propre énergie provoque des dégâts incroyables, lui faisant exploser la tête en morceaux et le jetant à l’eau.
Compte tenu du coup qui lui a été porté, il semble que Godzilla soit fini pour de bon, mais la dernière scène du film se tourne vers les morceaux de lui qui bouillonnent et commencent à guérir. Cela confirme que Godzilla n’est pas encore mort. Il lui faudra peut-être plus de temps pour guérir car les blessures étaient exponentiellement plus mortelles que celles auxquelles il a été confronté auparavant, mais il finira par parcourir à nouveau la terre et faire des ravages.